A Fiocruz reúne um vasto material bibliográfico disponível nas formas física e virtual (Biblioteca Virtual em Saúde – BVS). Além das bibliotecas, o acervo acadêmico da instituição também está reunido em dois ambientes virtuais: um é o Repositório Institucional – ARCA e outro é a Base de Teses e Dissertações.

Como biblioteca temática na área de saúde atende as seguintes subáreas: Saúde Ambiental, Saúde Mental, Saúde Coletiva, Epidemiologia, Saúde Indígena, Ciências Humanas e Sociais, Antropologia da Saúde, Biologia Celular e Parasitária, Imunoparasitologia, Diversidade Microbiana, Biotecnologia para Saúde e Metodologia de Pesquisa.