Garantir a elevação da escolaridade e a formação técnica profissional dos Agentes Indígenas de Saúde (AIS), é a proposta do Projeto pedagógico do curso técnico de Agente Comunitário Indígena de Saúde: Ensino médio indígena integrado à educação profissional técnica de nível médio, uma iniciativa do ILMD Fiocruz Amazônia, surgida a partir da necessidade de formação 250 Agentes atuantes no Distrito Sanitário Especial Indígena (DSEI) do Alto Rio Negro, a fim de assegurar que estes permaneçam trabalhando em suas comunidades. Uma equipe do ILMD e da Escola Politécnica de Saúde Joaquim Venâncio (EPSJV) Fiocruz Rio de Janeiro, iniciou as primeiras atividades do curso técnico profissionalizante em janeiro de 2009.