Criado para apoiar o desenvolvimento de vacinas contra doenças negligenciadas (dengue, influenza, doença de Chagas, leishmaniose, leptospirose, malária (Plamodium vivax) e toxoplasmose), o INCTV está estruturado em três divisões principais: Divisão de Imunologia Básica; Divisão de Tecnologia de Vacinas; e  Divisão de Desenvolvimento de Vacinas. É coordenado pelo Dr. Ricardo Tostes Gazzinelli,  do Centro de Pesquisa (CPqRR)/Fiocruz Minas, tem dentre seus participantes o pesquisador do ILMD Dr. Paulo Afonso Nogueira.